1992 թվականի հունիսին Լուժկովը Մոսկվայի երկրորդ քաղաքագլուխն Է դարձել Գավրիիլ Պոպովից հետո: Նա քաղաքը ղեկավարել Է 18 տարի: 2010 թվականի սեպտեմբերի 28-ին ՌԴ-ի այն ժամանակվա նախագահ Դմիտրի Մեդվեդեւը նրան պաշտոնաթող արեց «վստահության կորստի կապակցությամբ»: